(抗擊新型肺炎)超算技術(shù)投入新型冠狀病毒基因組分析
中新網(wǎng)北京3月3日電 (記者 劉育英)英特爾、聯(lián)想以及華大基因3日宣布,三家公司正攜手加快COVID-19新型冠狀病毒的基因組特性分析。
在基因測序工作中,每毫升體液通常會包含數(shù)百萬個不同的病毒體,而每個病毒體的基因組則包含大約30,000個DNA堿基或字母。華大基因正在對許多感染患者和疑似感染患者的微生物進行基因測序,因此這些研究工作將會生成TB級乃至PB級的海量數(shù)據(jù)。
要想高效地快速處理這些重要數(shù)據(jù),就需要采用更為先進的高性能計算基礎架構(gòu)、計算技術(shù)以及優(yōu)化的基因組分析方法。
英特爾和聯(lián)想攜手為華大基因提供的技術(shù)包括一個大型高性能計算集群,可用于處理從華大DNBSEQ-T7測序系統(tǒng)讀取的高通量數(shù)據(jù)。華大基因的研究人員將能夠通過全新的高性能計算和基因組分析技術(shù),以及英特爾和聯(lián)想的相關(guān)資源和專業(yè)知識,進一步加速他們對新型冠狀病毒的基因組特性研究。
該技術(shù)將支持科學家研究病毒的毒性、傳播模式、病原體與宿主間的相互作用,進而助力流行病學及疫苗設計研究。這些工作對于未來創(chuàng)建更好的診斷方法和設計有效的疫苗或其他保護性措施(例如免疫療法)是非常必要的。
通過這項合作,華大基因?qū)⒌靡岳^續(xù)優(yōu)化其新型冠狀病毒檢測試劑盒并獲取大量有價值的信息。(完)